颜色不同，南红玛瑙颜色为鲜红色，玛瑙颜色有红色、紫色等；质地不同，南红玛瑙有玉质感，玛瑙有玻璃质感；纹路不同，南红玛瑙有朱砂点分布，玛瑙纹路为半月状；含义不同，南红玛瑙是玛瑙的一个种类；产地不同，南红玛瑙主要产于云南，玛瑙在各个省份都有分布。

1、颜色不同

南红玛瑙的颜色为纯正的鲜红色，色彩浓郁，非常鲜艳美丽，玛瑙的颜色非常丰富，有红色、紫色、绿色、蓝色黑色、白色等颜色，色调之间有明显的层次感，颜色较浅。

2、质地不同

南红玛瑙的质地温润光滑，入手时有明显的玉质感，温温润润的，玛瑙的质地细腻冰凉，入手的感觉冰冰凉凉的，和玻璃的感觉非常相似，触感没有南红玛瑙的光滑。

3、纹路不同

南红玛瑙在强光下可以看到表面有很多细小的朱砂点，分布非常密集整齐，具有层次感，这是南红玛瑙独有的特点，玛瑙的纹理一般呈现出半月状，分布较为松散，纹路深浅不一。

4、含义不同

南红玛瑙属于玛瑙的一个品种，包含的意义范围较小，玛瑙的包含意义非常广泛，南红玛瑙也可以叫做玛瑙，玛瑙将南红玛瑙包括在里面，所以两者的意义不同。

5、产地不同

南红玛瑙主要产于云南的保山，在甘肃的迭部和四川的凉山等地也有分布，玛瑙的产地分布广泛，在四川、陕西、湖北、云南、河南、安徽等地也有分布。