玛瑙的种类有很多，分别可以按照颜色，纹路，内部杂质和产地来划分。

红玛瑙是常见的硅氧矿物，它基本上就是石英，很多性质都与石英相同。我们熟悉的雨花石，其实就是红玛瑙。红玛瑙在矿物学上还属于玉髓的变种。它的颜色多种多样，而且常常是呈多种颜色的。一般为半透明到不透明。红玛瑙是一种低级别的宝石，但人类将它加工成工艺品的历史却很久了。有的红玛瑙里面还有水，叫水胆玛瑙。

缟玛瑙是隐晶型的石英，组成十分优良的矿物石英及摩根石。缟玛瑙蜡质光泽，并也有半透明的品种。它的颜色通常是白色或灰色，灰蓝色或树荫下棕色等，从苍白到接近黑色。红缟玛瑙有扁平黑白阶。火石也是各种各样的缟玛瑙。

玛瑙中有封闭的空洞，其中含有水或水溶液，这种玛瑙即称为水胆玛瑙。摇晃时汩汩有声。以“胆”大“水”多为佳。透明度高且无裂纹和瑕疵的水胆玛瑙，是极好的玉雕材料。水胆玛瑙，乃自然界形成的玛瑙中包裹有天然形成的水。在玛瑙制品中尤为稀罕。要把水胆玛瑙雕琢成工艺品。水胆玛瑙的形成历史久远。大约在一亿年以前，当成分复杂的地下岩浆在地质作用的影响下冲破地表时，由于温度和压力的骤降，岩浆就会迅速冷却凝固，同时溢出大量含有二氧化硅的溶液，这种极高温的溶液会沿着冷却中的岩石的裂缝流动，继而将空洞填充。

凉山南红玛瑙是近年新发现的南红玛瑙矿石。产于四川凉山美姑县，又称为美姑玛瑙，近几年由于凉山南红的高品质，凉山南红成了奇石玩家们追逐的对象，保值收藏的奇货。凉山南红玛瑙的产地，主要集中在四川凉山自治州美姑县和昭觉县交界处的山区地带，这里海拔达到2000一3900米，地形复杂，交通不便，经济十分落后。凉山南红玛瑙被发现以前，这里是原始、古朴和安静的。位于美姑县城西南的九口乡一带，是凉山南红玛瑙最著名的产地，让人爱不释手的柿子红和火焰纹大多产于这里的坑口。